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而沿着乘员舱再网上，就是机库和指挥中心了。
这里陈新参考了航母的机库与甲板的设计，指挥中心采用了类似的舰岛设计，位于整辆移动基地的右侧，并且上下贯通了乘员舱和轮机舱，安装了电梯便于命令的传达和人员的移动。
机库本身空间并不算太大，最多可以容纳六架折叠了桨叶的直升机，左侧则是一块可以伸缩的停机坪，在展开的时候可供四架直升机同时进行起降。
至于说车顶的部分其实也是一块停机坪，有一台航母上类似的升降机负责升降飞机。
顶部停机坪的强度是按照航母的强度标准设计的，可以从里面打开，展开整个机库不说，在闭合的情况下也可以允许具备垂直起降功能的战斗机进行起降。
除此之外，陈新在整个移动基地的整体结构中是留了一个设计余量的，可以在整个移动基地靠近车头和车尾的部分各安装一个军舰上通用的垂直导弹发射井，或者放弃使用顶层的垂直起降甲板，取消开合功能直接布设导弹。
当然，这些设计余量是留给军方改造使用的，陈新自己并没有在这两台移动基地上装这些，只是在顶部的指挥中心舰岛前面装了一门130mm火炮，用于清障而已。