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荣字1644细菌部队的成立，无异给当时多灾多难的南京又带来一个可怕的创伤，曰本细菌部队的幽灵便也开始在南京城内闪现。
荣字1644部队成为继满洲731部队、满洲100部队之后石井的细菌战研究的第三个重要场所。而石井本人则在担任731部队队长之后，同时担任1644部队的第一任部队队长。1644部队本部设在南京中央陆军医院之上，即市中心的中山东路路北。路南是明故宫飞机场，东面是汉歼伪政权的军官学校，西南是航空队宿舍。
该部队南京本部范围内有两座主要的大楼，一座楼高六层，是司令部大楼，是司令官办公室和各个行政单位的办公室；另一座四层的楼房，是副楼，但却是部队的心脏，因为这里是进行细菌战研究和关押细菌实验用的“犯人”的囚室。
另外，该部队还在本部北边的太平门附近九华山下设立了附属机构，伪称“血清疫苗制造所”，实际上是生产细菌的工厂。
除此之外，1644部队还在上海、苏州、常州、杭州、九江、南昌、安庆、汉口等地设立12个支队，全部工作人员约1500人。细菌、化学实验的罪恶和细菌战的兽行南京1644细菌部队的设施尽管在规模上比731部队和100部队的规模要小，但它却拥有巨大的细菌生产能力。如果开动南京的全部设备，荣字1644部队一个生产周期能生产10公斤细菌。在进行细菌培养的同时，1644部队还进行跳蚤的繁殖，为了繁殖跳蚤共用了约100只汽油桶。随着一个个生产周期的运行，一群又一群的跳蚤从这些汽油桶里蜂拥而出，而细菌专家便拿它们来进行鼠疫试验。
肖雄通过各种途径了解到了鬼子正在进行的细菌战的情况，但是，他更为迫切的是要了解在赣北的鬼子所正在进行的细菌战的研究和实施情况。
不久，各地调查的情报就开始源源不断的汇总到了肖雄那里。肖雄的注意力就放在了九江城区，他要找出鬼子在九江的细菌研究所及其细菌制造工厂。
浔阳城是1938年7月陷落的，侵华曰军强占圣约翰医院后，设立了177兵站医院。另一所值得肖雄关注的地方就是九江的同仁医院。曰军侵占九江后，初借天主堂医院供伤病员医疗所用。1941年12月，曰军占领该医院的四分之三并开办了同仁医院，之后又强占了远处的福德医院作其院舍，并设有医疗、防疫两班(防疫班分住城内和江对岸黄梅的小池口)，共40余人。
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